Наболело… не знаю, что и делать, может у кого есть какие идеи?

Давно пользуюсь почтой гугл, удобно, несколько ящиков, один персональный, другой – аккаунт для андроида. Короче, все было хорошо. До недавнего времени. Пока какой-то мудак альтернативно-одаренный не принял решение сменить интерфейс почты. Старый был отличный. Быстрый, с кучей тем, очень привлекательный и удобный. В ноябре они стали предлагать перейти на новый интерфейс почти. Попробовал. Мерзость. Мало того, что минималистичный интерфейс просто ужасен сам по себе (хотя в целом мне подобный стиль нарвится, но в их исполнении - дерьмо). Так он ещё и безбожно тормозит! Пользоваться им невозможно совершенно, особенно на не слишком мощном компе (например, на моем нетбуке, который у меня как рабочая машина). Блин, это даже не онлаин-игра и не фотошоп какой-нибудь! Это веб-интерфейс! Старый – летал. Новый – все делается рывками и с огромными лагами. Да и в целом, внешне он стал гораздо менее удобным. Например, я до сих пор не могу найти, что бы письма помечались значками “отвечено”, “переслано” и т.д.

Ну а теперь – к самому замечательному. Изначально новый интерфейс был типа тестовым, что бы все попробовали – можно было вернуться к нормальному, старому, нажатием одной кнопки. И сразу появляется куча гогло-форумов, на которых люди жаловались, какой он тормозной, неудобный и некрасивый. Но гугл, само собой, пошел по пути Эппла (потрясающее решение) – “юзеры идиоты и сами не знают, чего хотят, а мы знает и дадим им это, даже если им это нафик не сдалось”. Ну и понеслось: никаких ответов к претензиям пользователей небыло (ну кроме стандартных: почистите кэш (не работает), перейдите на Хром – ага, ага, из-за почты). И само собой, в какой то прекрасный момент (где-то в марте-апреле) кнопка “вернуть старый интерфейс” просто изчезла, при этов все лаги и “дизайн” так и остались, все комментарии гугл просто тупо проигнорировал. И никакие скрипты уже не работают. Так что остается “наслаждаться” новой поделкой этих уродов. Хотя старое прекрасно работало и не требовало никаких изменений, ну совершенно!

А теперь, внимание, вопрос: есть ли какие-либо решения проблемы? Продолжать использовать веб-интерфейс, но допилить его до более-менее рабочего состояния? Только не надо предложений типа “переходи на Хром” или “используй почтовые клиенты”. По ряду причин это не подходит. С какой стати я должень менять мою любимую Оперу (которой уже пользуюсь 10 лет, юбилей таки в этом году!) и к которой у меня уже полнейший автоматизм на сочетания клавиш и клики? Почтовые клиенты не подходят, потому как пользуюсь несколькими компутерами, и надо будет постоянно синхронизировать базы… короче, морока себя не оправдает.

Как вариант, пробовал Magic Mail Monitor – хорошая программка, скачивает заголовки писем с сервера и потом можно сразу ненужное удалить, а нужное закачать и почитать. Но: скачивает письма до августа прошлого года с одного аккауна, до декабря – с другого – и все, дальше говорит новых писем нет. Причем пробовал 2 разные программы, у обеих такая проблема – явно дело в самом гугле.

Какие есть идеи?

Вот тут наткнутлся: тыц. Даже не могу понять, противно это читать или смешно. Скорее противно, наверное. Интересно, товарищ сам действительно верит в то, что пишет, или так стебается (или стебется, как правильно)?

“Год 60-летия пребывания королевы на троне, горький года для каждого уважающего себя британца…”

ага, ага, бедные британцы. Год назад национальный праздник праздновали, свадьбу принца – их конечно заставили, всех поголовно.

“Британский народ настолько потерял жизненные ориентиры, что ему буквально ничего более не остается, как отбросив новогоднее настроение предаваться пороку и  праздновать, словно в последний раз”

У британцев это национальное уже много-много лет, ничего особо необычного небыло.

Ну, там ещё много подобных фантазий воспаленного сознания… Блин, и ведь кто-то им верит…

upd: все-таки пародия, не принимайте всерёз

Обычно апрель в Великобритании достаточно мягкий, теплый – весна, как её обычно представляют. Однако в этом году погода, судя по всему, сошла с ума. Весь апрель лили дожди, было ветренно и холодно (собственно, погода практически не отличалась от декабря-января). Вчера, судя по всему, была кульминация: температура не выше 5, наверное, дождь (правда к обеду он закончился) и ураганный ветер. Мне, как назло, надо было ехать (причем вечером!) на работу, делать эксперимент. Сам не знаю, как меня не сдуло на велике. Наверное, если б ветер дул сбоку, точно б сдуло. Но он был встречный. Так что при скорости 10 км сил тратилось, как при 25 :-( Все дорожки усыпаны сломанными ветками.

Приехал на работу, увидел из окна такую вот картинку:

Дерево высотой около 6 этажей (ну может 5), елси судить по зданию рядом. Полиция перекрыла дорогу и всех отправляли в обьезд.

Зато сегодня: солнце с самого утра, температура как минимум 15. Неужели весна все-таки наступила?

Величайшая радость за последние пол-года! Последние 6 месяцев жил как на вулкане, сегодня почти получил сердечный приступ когда открывал конверт. Но… УРА! ILR получен!!!

Кто не в курсях, ILR – это последний тип визы в Великобритании, круче неё нет, дальше только гражданство. Неограниченная по сроку действия виза, и необходима для получения гражданства в будущем, если будет такое желание.

Ура, товарищи!

Посмотрел  Sweeney Todd – The Demon Barber Of Fleet Street. Это, конечно, очень сильно. Депп прекрасно поёт, остальные тоже неплохо. Бертон просто гений в таких мрачных постановках. Впечатление после кино сильнейшее, местные мясные пироги (meat pies) я теперь долго есть не буду! Фильм однозначно всем советую, лучше конечно в оригинале, что бы прочувствовать все песни, переводом это не передать.

Короче, шефиня уехала на конфу, пошли сегодня в пуб на обед. Пуб наш, локальный, можно сказать университетский. Короче, идем, и вдруг чего я вижу? Вот самое оно:

Короще, такую тусовку прое пропустил… я плакаю :-(

Писал сейчас письмо коллабораторам, хорошо что перечитал, чего написал. Чуть не отправил им, что бы секвенировали whore genome, вместо whole genome. Разница в одной букве, зато какой эффект! Было бы смешно, если б отправил…

Сегодня я испытываю очень двойственные чувства. С одной стороны, наконец-то случилось то, на что я надеялся все время работы в Манчестере: я нашел мутацию в мышиной линии, с которой мы работаем. Эту мутацию пытались найти более 6 лет, 2 аспирантки сделали докторов (точнее, одна сделала, другая сейчас заканчивает диссер), анализируя этих мутантных мышей. Но вот где эта самая мутация – никто так и не нашел. А я – нашел! Буквально утром получил подтверждающие сиквенсы. Так что УРААА!

С другой стороны – пичалька. Нет, ПИЧАЛЬКА! Все дело в том, что именно мутировано. А мутирован, к сожалению, очень плохой ген. Точнее, плохой для нас :-( Мы очень надеялись, что это будет ген, учавствующий в эмбриональном развитии сердца или симметрии тела или что-то подобное, специфическое. На деле оказалось – ЖОПА. Причем полная. Потому как мутирован ген Prpf8 – ген, кодирующий центральный компонент сплайсосомы, РНК-белкового комплекса, необходимого для сплайсинга РНК.

Сплайсосома

Если коротко: ДНК эукариот (к которым относимся и мы с вами) не вся кодирует белки. Помимо некодирующего межгенного пространства ДНК, в самих генах (участках, содержащих кодирующую последовательность нуклеотидов) есть участки кодирующие (экзоны) и некодирующие (интроны). При транскрипции (процессе синтеза матричной РНК, мРНК, по матрице ДНК) ген считывается полностью, однако потом мРНК подвергается рядумодификаций, самой пожалуй важной из которых и является сплайсинг – вырезание некодирущих участков (серые на картинке ниже) и сшивание кодирующих (синие).

мРНК. Синие участки – кодирующие последовательности, серые – некодирующие.

Таким образом, после сплайсинга получается непрерывная кодирующая последовательность РНК, согласно которой синтезируется белок.

В разных белках количество экзонов может сильно отличаться: в некоторых 2-3, в некороых – больше 50 (не знаю максимального количества, однако думаю, может в отдельных тяжелых случаях и до сотни доходит). Все бы ничего, однако существует такая штука – альтернативный сплайсинг, при котором экзоны объединяются в различных комбинациях, выдавая в результате различные формы зрелой мРНК. Само собой, что и белковые продукты будут сильно отличаться. Причины альтернативного сплайсинга можно почитать по ссылке выше, не суть важно. Что важно, это то, что альтернативные формы одного и того же белка обладают разный функциональностью и активностью, и могут специфично встречаться в разных типах клеток и тканей. Соответственно, синтез варианта белка, неспецифичного для определенного типа клеток, может привести к совершенно непредсказуемым результатам.

И вот так уж случилось, что наша искомая мутация находится в гене Prpf8 – главном белке сплайсосомы, которая и отвечает за правильный сплайсинг мРНК. Судя по всему, мутация приводит к появлению нового сайта фосфорилирования – модификации белков, которая  пожалуй, наиболее активно используется клеткой для регулирования активности ферментов. Как правило, фосфорилирование/дефосфорилирование просто-напросто включает/выключает фермент, однако может и менять его активнось либо специфичность (тут я не эксперт, если что неправильно скажу – не ругайте сильно). Суть в том, что подобная модификация белка Prpf8 скорее всего приведет к его неправильной активности либо специфичности (или и тому, и тому), и как результат в клетке будут производиться неправильнные версии белков. Главная проблема в том, что предсказать, какие именно белки будут неправильно производиться, как именно неправильно и к чему эта неправильность приведет – невозможно (поскольку сплайсосома работает со ВСЕМИ белками в клетке). Если плясать от конкретного белка, то все это можно выяснить, и довольно просто. Однако таких неправильных белков могут быть сотни, и наблюдаемый нами фенотип – результатом комбинаторного действия десятков неправильных белков… Так что сейчас у меня ПИЧАЛЬКА, большая такая. Так и живем – большое СЧАСТЬЕ и большое ГОРЕ одновременно.

В четверг иду на их представление – Alegria:

Год назад уже видел вживую другое их представление – Totem. Зрелище потрясающее и незабываемое. Надеюсь, это будет не хуже. Завидуйте, короче ;-)

*NGS – Next-Generation Sequencing

Вообщем, скатался я в ЛиверБуль. Интересная была встреча, полезная (хотя конкретно для нас немного менее полезная, чем для многих других участников). Но появились новые идеи к анализу сиквенсов, последние два дня сидел и писал скрипты для подготовки данных к анализу.

Сама встреча (курс) в основном для молодежи, хотя и не совсем: были все возраста, начиная от PhD студентов первого года до уже матерых постдоков под 35. Всего около 20 человек. Рассказывали нам о разных платформах для секвенирования, подготовке библиотек ДНК, представители трех фирм рекламировали свои продукты (само собой, у каждого “самый лучший продукт” :-). Ну и само собой (ради чего я и ездил) о методах анализа данных, наиболее распространенном софте и показали как пользоваться парой приложений (хотя как выяснилось, с этими конкретными я уже хорошо знаком). А анализ данных там нужен серьёзный, размеры файлов с сырыми данными “из машины” могут достигать десятков гигабайт, проанализировать это вручную невозможно, да и компьютер не каждый справится: обычно эти программы запускают на специально предназначенных для этого серверах, и даже там они работают сутками, выполняя только один этап обработки.